Buenas Tardes , puede ser físico o lógico, revisa si bien los bridge que tengas en tu configuración o los cables que no salgan y entren al mismo equipo.
También puede ser por mal ponchado, revisa el poe, posible daño en el chip lan del AP, conecta el ap directamente a la pc y revisa a cuánto está linkeando si a 10,100,1000, si es un ap con puerto gigabit y si funciona a 100 o 10mb full dúplex posiblemente este averiado, tendrías que configurar el puerto del MikroTik manualmente, por defecto viene auto cámbialo a 100mb full dúplex y ve probando.